Biyoinformatik Analizler Hakkında
Biyoinformatik, genomik verilerden epigenetik profillere, metagenomik çalışmalardan transkriptomik analizlere kadar genetik bilgiyi anlamlandırmak için kullanılan en güçlü araçlardan biridir. Modern biyoteknoloji ve sağlık araştırmalarında, büyük ölçekli verilerin işlenmesi ve anlamlı hale getirilmesi için biyoinformatik analiz kritik bir rol oynar.
Biyoinformatik Hizmetler
Genomik Analizler
Transkriptomik Analizler
Transkriptomik Analizler
- De novo ve yeniden dizileme genom birleştirme: Yeni türler veya referans genom bulunmayan organizmalar için.
- Gen tespiti ve genom anotasyonu: Fonksiyonel bölgelerin ve genlerin belirlenmesi.
- Karşılaştırmalı genomik analizleri: Farklı türler veya bireyler arasında benzerlik ve farklılıkların ortaya çıkarılması.
- SNP anotasyonu ve varyant çağırma: Genetik çeşitliliğin belirlenmesi.
- Yolak analizi: Genetik verilerin biyolojik yollarla ilişkilendirilmesi.
- PZR amplikon dizileme analizi
- Filogenetik yapılandırma: Evrimsel ilişkilerin ortaya konması.
- GWAS (Genom boyu ilişkilendirme çalışmaları)
- Moleküler tanı
Transkriptomik Analizler
Transkriptomik Analizler
Transkriptomik Analizler
- RNA-seq transkript birleştirme ve anotasyonu
- Diferansiyel gen ifadesi analizleri: Sağlıklı vs. hasta, tedavi öncesi vs. sonrası gibi karşılaştırmalar.
- Mikrodizi analizi
- İfade imzası keşfi: Hastalık biyomarkerları ve gen ifade paternleri.
- miRNA tespiti ve ifade analizi
- ChIP-seq analizi: DNA-protein etkileşimlerinin incelenmesi.
Metagenomik Analizler
Yazılım ve Veri Çözümleri
Yazılım ve Veri Çözümleri
- 16S/18S/ITS rRNA dizileme analizi ve taksonomik biyobelirteç tespiti
- De novo metagenom anotasyonu
- Metagenom boyu ilişkilendirme çalışmaları (MGWAS)
Yazılım ve Veri Çözümleri
Yazılım ve Veri Çözümleri
Yazılım ve Veri Çözümleri
- Veri görselleştirme: Büyük verilerin anlaşılır grafik ve şemalara dönüştürülmesi.
- Moleküler tanı araçları geliştirme
- Biyoinformatik boruhattı mimarisi oluşturma (pipeline design)